Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SvoplQ6PDF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms