Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl2Q6PA06 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl2Q6PA06 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms