Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx6Q6P8X1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms