Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Podnl1Q6P3Y9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Podnl1Q6P3Y9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms