Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac10Q6P3E7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdac10Q6P3E7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms