Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrimpolQ6P1E7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrimpolQ6P1E7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms