Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx4Q6P1D7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx4Q6P1D7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx4Q6P1D7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms