Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Paxip1Q6NZQ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms