Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpsf6Q6NVF9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms