Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frem2Q6NVD0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Frem2Q6NVD0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms