Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SphkapQ6NSW3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SphkapQ6NSW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SphkapQ6NSW3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms