Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Carmil1Q6EDY6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil1Q6EDY6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms