Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop58Q6DFW4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop58Q6DFW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms