Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms