Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Frem1Q684R7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Frem1Q684R7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem1Q684R7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Frem1Q684R7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Frem1Q684R7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Frem1Q684R7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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