Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CilpQ66K08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms