Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc3Q64519 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc3Q64519 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms