Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irf4Q64287 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Irf4Q64287 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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