Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zic2Q62520 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms