Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl12Q62401 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms