Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpd52Q62393 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpd52Q62393 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms