Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim28Q62318 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms