Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sprr1bQ62267 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sprr1bQ62267 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms