Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HrQ61645 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HrQ61645 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HrQ61645 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HrQ61645 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HrQ61645 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HrQ61645 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HrQ61645 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HrQ61645 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HrQ61645 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HrQ61645 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HrQ61645 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HrQ61645 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms