Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd55bQ61476 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd55bQ61476 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms