Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msi1Q61474 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms