Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna2Q61301 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna2Q61301 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms