Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf1Q61069 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usf1Q61069 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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