Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxd3Q61060 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms