Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms