Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb1Q61009 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Scarb1Q61009 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb1Q61009 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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