Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf3Q60980 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf3Q60980 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms