Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp4Q60972 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms