Protein–RNA interactions for Protein: Q60948

Mxd4, Max dimerization protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd4Q60948 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mxd4Q60948 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mxd4Q60948 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms