Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Neurod1Q60867 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Neurod1Q60867 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms