Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2dQ60773 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2dQ60773 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 457.3 ms