Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms