Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajc11Q5U458 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnajc11Q5U458 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms