Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms