Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd40Q5SUE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd40Q5SUE8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms