Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tns3Q5SSZ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tns3Q5SSZ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms