Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms