Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf12Q5SPL2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms