Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav6-2Q5R1I4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms