Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND04

Hsf5, Heat shock factor protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf5Q5ND04 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf5Q5ND04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms