Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3558Q5FWC9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Gm3558Q5FWC9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm3558Q5FWC9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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