Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nlrc3Q5DU56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc3Q5DU56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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