Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prss53Q571E5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss53Q571E5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss53Q571E5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms