Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccnl1Q52KE7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnl1Q52KE7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms