Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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